fbpx
Bizi Takip Edin

Bilim

Dna Kullanarak Dakikalar İçinde Kimlik Doğrulayabilen Yazılım Geliştirildi

Yayınlandı

üzerinde

Kolombiya Üniversitesi ve New York Genom Merkezi’nden (NYGC) araştırmacı ekipler tarafından geliştirilen yeni yazılım, DNA kullanarak kimliği hızlı ve doğru bir şekilde doğrulamaya yardımcı olacak. Yöntem, gerçek zamanlı olarak 10-20 GB’lık verileri sıralayabilen küçük, kredi kartı boyutunda bir cihaz olan Minion DNA sıralama cihazını kullanmayı içeriyor.
Çalışmanın kıdemli yazarı, NYGC’nin üyesi ve Kolombiya Veri Bilimi Enstitüsü üyesi olan Yaniv Erlich, “Yöntemimiz, toplum yararına hazır teknoloji kullanmak için yeni yollar açıyor” diyor. Bu araştırma eLife dergisinin son sayısında yayınlandı.

İki aşamalı süreçte, araştırmacılar, Minion ile dizilen DNA’dan bireysel varyantları (benzersiz nükleotidler) aldılar. Ve veri tabanındaki diğer genetik profillerde benzersiz her varyant setini, karşılık gelen varyantlarla karşılaştırmak için bir olasılık algoritması (Bayes Algoritması da denir) uyguladı. Her bir çapraz referans ile bir eşleşme doğrulama olasılığı artar ve arama daralır. Test, sistemin yalnızca bir kaç dakika içinde 60-300 çapraz referans arasında bir eşleşmeyi doğrulama kabiliyetine sahip olduğunu gösterdi.
Bu teknoloji önemli potansiyel uygulamalara da sahiptir. Afet Kurbanı Tanımlama (DVI) uzmanlarının, uçak kazaları veya depremler gibi büyük felaketlerden sonra cesetleri tespit etmesini kolaylaştıracaktır. Tecrübeli bir DVI uzmanı Richard Bassed, Vice’a verdiği demeçte, vücudu tanımak için DNA kullanımının pahalı olduğunu ve diş veya tıbbi kayıtları incelemek gibi yöntemlerden daha fazla zaman aldığını söyledi. Minion ve bu yeni yazılım, hem maliyeti hem de doğru tanımlamanın gerçekleştirilmesi için gerekli süreyi azaltabilir. Teknoloji aynı zamanda önemli kanser araştırmalarında boşa harcanan kaynak ve zamanı azaltmaya da yardımcı olabilir.

Yeni yöntem ayrıca, laboratuvarların, hücre hatlarını nispeten ucuz bir fiyata kolayca doğrulamasına da imkan tanıyor. NYGC’nin temel öğretim üyesi ve NYU Biyoloji Bölümü’nden asistan profesör Neville Sanjana, “Doğru fiyata her laboratuvar bunu kabul edecek” dedi.
Yazılım zaten bir genel kamu lisansı (GNU) altında GitHub’da indirilebiliyor. Bu nedenle laboratuvarınız bugün dünyayı değiştirmeye başlayabilir.
Kaynak: https://futurism.com/software-verify-id-dna/

Bilim

Bilim insanları, CRISPR ile DNA yerine RNA düzenleyebilecek

Yayınlandı

üzerinde

Yazan

CRISPR hiç şüphesiz yaşam bilimlerindeki çalışmalara büyük bir ivme kazandıracağı aşikar. Bu teknoloji ile çok kısa sürede sonuçlar alınmasının yanında maliyeti bakımından diğer teknolojilere göre çok daha uygun. CRISPR teknolojisi son 10 yıldır en çok ilgi duyulan gen düzenleme teknolojisidir. Bilim insanları, gen düzenleme teknolojisi CRISPR ile Deoksiribo Nükleik Asit (DNA) yerine Ribo Nükleik Asidi (RNA) hedef alabilen bir enzimin moleküler yapısının haritasını çıkarmayı başardı.

Techcrunch’ın haberine göre, ABD’de Salk Enstitüsünde görevli uzmanlar, gen düzenleme teknolojisi CRISPR ile RNA’nın hedef alınabileceği Cas13d enziminin moleküler yapısını ayrıntılarıyla saptadı. Çalışmanın, gen düzenleme teknolojisinde hücre içindeki fonksiyonların daha kusursuz yönlendirilmesine olanak sağlayacağına inanılıyor. Araştırmanın ayrıntıları “Cell” dergisinde yayımlandı. Münferit hücre içindeki kusurların ortadan kaldırılması için Cas9 enzimiyle DNA’nın hedef alındığı gen düzenleme teknolojisinin, sanılandan daha büyük genetik yıkıma neden olabileceğinden endişe ediliyor.

Bilim adamları, RNA’yı hedef alan CRISPR-Cas13d enzimiyle hücrelerin işlettiği mekanizmaların düzenlenebileceğini, genin üzerinde kalıcı ve potansiyel tehlike oluşturan değişiklikler yapılmayacağına işaret etti. Araştırma ekibinden Hanna Gray Fellow, “DNA sabittir, sürekli değişen, DNA’dan kopyalanan RNA iletileridir. Doğrudan RNA’yı kontrol ederek bu iletileri düzenlemek, hücrenin kaderini etkilemek açısından önemli olası sonuçlar barındırıyor.” ifadesini kullandı.
Kaynak: https://www.genengnews.com/gen-news-highlights/detailed-structure-of-crispr-enzyme-for-rna-editing-technology-described/81256259

Devamını Oku

Bilim

Ahtapot ve İnsan Beyni Arasında Benzerlik Keşfedildi

Yayınlandı

üzerinde

Yazan

Johns Hopkins Üniversitesi’nden nörobiyolog Gül Dölen ve evrimsel biyolog Eric Edsinger, insanlar ve ahtapotlar arasında genetik bir benzerlik keşfetti. Araştırmada ahtapotlara, MDMA ve ecstasy adlı kimyasal ilaçlar verildi. Kimyasal ilacın etkisinde olan ahtapotlar, insanların MDMA ve ecstasy kullandıktan sonra verdikleri tepkinin aynısını verdi.

Laboratuvar sonuçlarında; ahtapot ile insan beyni arasındaki anatomik farklılıklara rağmen, serotonin taşıyıcı geninde moleküler benzerlikler olduğu tespit edildi. Ahtapotların ilaçlardan sonra mutluluk, depresyon ve üzüntü duygularında değişimler yaşadığı gözlemlendi.

Gül Dölen ”İnsanlar da MDMA ve ecstasy alındığında mutluluk, depresyon ve üzüntü duygularında değişimler yaşıyor. Ahtapotların ilaca verdiği tepkiler de aynen böyleydi. Bu sonuçlar sayesinde, psikiyatri ilaçları ve antidepresanların dozları daha verimli ayarlanabilecek.” dedi.(+Nörotransmitter: Nöronlar arasında veya bir nöron ile başka bir hücre arasında iletişimi sağlayan kimyasallara nörotransmitter denir.)
(+Serotonin: İnsanda mutluluk, canlılık ve zindelik hissi veren bir nörotransmitterdir. Eksikliğinde depresif, yorgun, sıkılgan bir ruh hali görülür. Yapısal olarak monoamin grubuna girer ve triptofan aminoasitinden sentezlenir. )
Kaynak: https://www.sciencealert.com/california-two-spot-octopus-octopus-bimaculoides-prosocial-behaviour-mdma-ecstasy-serotonin?perpetual=yes&limitstart=1
Editör / Yazar: Kuzey KILIÇ

Devamını Oku

Bilim

Probiyotik Bakterilerinin Şok Edici Sırrı: Elektrik Üretiyorlar

Yayınlandı

üzerinde

Bugüne kadar, elektrik üreten bakterilerin çoğu garip ortamlardan gelmiştir.Ancak araştırmacılar hem mikrojen hem de probiyotik olmak üzere insan mikrobiyomunda 100’den fazla elektrik üreten değer bulmuşlardır. Bakterilerin elektrojenik yetenekleri, enfektivitede veya peynir ve yoğurdu nasıl fermente ettikleri açısından önemli olabilir.

Listeria bakterisi, hücre duvarları boyunca elektronları, her yerde bulunan flavin molekülleri (sarı noktalar) ile desteklenen küçük akıntılar olarak çevreye taşır. Mayınlar ve göllerin dibi gibi egzotik ortamlarda elektrik üreten bakteriler bulunurken, bilim adamları ev halkına daha yakın bir kaynağa yöneldiler: insan bağırsağı. Kaliforniya Üniversitesi’den bilim insanları, yaygın bir ishale neden olan bakteri Listeriamonocytogenes’in, bilinen elektrojenik bakterilerden tamamen farklı bir teknik kullanarak elektrik ürettiğini ve yüzlerce başka bakteri türünün de aynı süreci kullandığını keşfettiler.

Bu kıvılcım bakterilerinin çoğu, insan bağırsağı mikrobiyomunun bir parçasıdır ve birçoğu, gıda kaynaklı hastalık listeriyozuna neden olan ve aynı zamanda düşüklere de neden olabilen patojeniklerdir. Kangrene ( Clostridiumperfringens ) ve hastane kaynaklı enfeksiyonlara ( Enterococcusfaecalis ) ve bazı hastalıklara neden olan streptokok bakterileri oluşturan diğer bakteriler de elektrik üretmektedir.

Lactobacilli gibi diğer elektrojenik bakteriler, yoğurdun fermente edilmesinde önemlidir ve birçoğu probiyotiktir. Bu keşif bakterilerin bize nasıl bulaştığı konusunda çok şey söyleyebilir veya sağlıklı bir bağırsağa sahip olmamızı sağlayabilir. Aynı zamanda mikroplardan canlı piller oluşturmaya çalışanlar için oldukça sevindirici bir haber. Bu tür “yeşil” biyoenerjetik teknolojiler, örneğin atık arıtma tesislerinde bakterilerden elektrik üretebilir.
Kaynak: https://www.sciencedaily.com/releases/2018/09/180912133442.htm

Devamını Oku

Öne Çıkanlar